Eduardo Saverin nasceu em São Paulo , Estado de São Paulo , Brasil, filho de Roberto e Sandra Saverin Foi criado em Miami, Florida. Seu pai Roberto era um industrial brasileiro que trabalhava com exportação, vestuário, transporte e imobiliário. Eugênio Saverin, avô de Eduardo, era alemão, refugiado no Brasil. Em 1952, fundou a Tip Top, marca de roupas infantis, e trouxe para o mercado um dos primeiros modelos de macacão para crianças. Roberto Saverin chegou a trabalhar com o pai na fábrica de roupas infantis.
Em 1987, Eugênio vendeu a empresa para o grupo TDB, que até hoje controla a marca.
Em 1993, depois da descoberta que Eduardo estava na lista de “possíveis sequestrados”, em função da riqueza de seu pai, a família foi morar em Miami,Estados Unidos. Em 2003 Eduardo iniciou o curso de Economia na Universidade Harvard, fez pós-graduação e em 2006 recebeu seu MBA. Foi presidente da Associação de Investimento de Harvard e ficou conhecido por lucrar mais de US$ 300 mil apostando no mercado futuro do petróleo.
Saverin conheceu Mark Zuckerberg em seu segundo ano, enquanto jogava no Phoenix S K Club. Mais tarde, co-fundou o Facebook durante o primeiro ano de Zuckerberg, assumindo o papel de gestor de negócios. Durante o verão seguinte, Saverin se afastou do que era então conhecido como "thefacebook" devido a conflitos internos e as diferenças de opinião com Mark. Saverin estava morando em Nova York, onde trabalhou brevemente como um estagiário em finanças.
Como cofundador, Saverin realizou o papel de CFO e gerente de negócios. O conflito atingiu o pico quando as ações Saverin foram reduzidas de 34,4% para 0,03%.

